의원·치과·한의원 종합소득세 가이드 (2026년 귀속)

개원의의 종합소득세는 일반 자영업자와 기준이 다릅니다. 의료업은 수입금액과 관계없이 복식부기의무자이고, 단순경비율을 쓸 수 없으며, 수입이 늘면 외부세무조정·성실신고확인 대상이 됩니다. 법령 기준을 정리하고, TaxEasy가 지원하지 않는 범위도 함께 안내합니다.

1. 개원의 종소세 기준 한눈에

항목의료업 기준근거
기장의무수입금액과 무관하게 복식부기의무자소득세법 시행령 제208조⑤ 단서·제147조의2
단순경비율적용 불가 (신규 개업 포함)제143조⑦1
장부 없이 추계 시기준경비율의 1/2 + 무기장 가산세제143조③1다, 소득세법 제81조의5
외부세무조정직전 수입 1억 5천만원 이상 등제131조의2
성실신고확인해당 연도 수입 5억원 이상 (보건업)제133조①3
신고기한5월 31일 (성실신고확인대상자 6월 30일)2026년 귀속: 2027년 5월 31일(월)

2. 진료과목별 기준경비율 (2025년 귀속 고시, 참고용)

코드업종기준경비율추계 시 적용 (1/2)
851201일반과, 내과, 소아과27.9%13.95%
851202일반외과, 정형외과, 항문과, 신경외과27.5%13.75%
851204피부과, 비뇨기과25.9%12.95%
851205안과28.7%14.35%
851209성형외과16.1%8.05%
851211치과의원17.2%8.6%
851212한의원18.9%9.45%

추계 시 소득금액 = 수입금액 − 주요경비(정규증빙 매입비용·임차료·인건비) − 수입금액 × 기준경비율 × 1/2. 여기에 무기장 가산세까지 붙으므로 의원은 복식부기 장부 신고가 일반적입니다. 2026년 귀속 경비율은 2027년 고시 후 확인하세요.

3. 개원의가 챙길 점

① 2월 사업장현황신고 수입금액과 장부 일치

공단부담금·본인부담금·비급여를 모두 포함한 수입금액이 2월 신고와 5월 장부에서 같아야 합니다. 2월 과소신고는 0.5% 가산세 대상입니다.

② 개원 첫해·둘째 해 외부조정 여부 확인

복식부기의무자가 직전 과세기간에 사업을 시작했으면 외부세무조정 대상이 될 수 있습니다(시행령 제131조의2①2나, 단서 예외 있음). 개원 다음 해 신고는 세무대리인과 미리 확인하세요.

③ 의료장비 감가상각·리스

고가 의료장비는 구입 시 일시 비용이 아니라 감가상각으로 나눠 경비 처리합니다. 리스는 계약 형태(운용·금융)에 따라 처리가 다르므로 장부 작성 때 구분이 필요합니다.

④ 성실신고확인 대상이면 6월 30일까지

수입 5억원 이상이면 성실신고확인서 제출 대상이며 신고기한이 6월 30일로 늦춰집니다. 미제출 시 별도 가산세가 있습니다.

4. TaxEasy 지원 범위

TaxEasy의 종합소득세 자동신고는 간편장부·기준/단순경비율 방식을 대상으로 합니다. 복식부기의무자 신고, 외부세무조정, 성실신고확인은 지원하지 않습니다. 의료업은 모두 복식부기의무자이므로 개원의의 종합소득세는 세무대리 영역으로 보시는 것이 맞습니다. 대략적인 세액은 무료 계산기로 확인할 수 있습니다.

5. 자주 묻는 질문 (FAQ)

의원도 간편장부로 신고할 수 있나요?

아니요. 의료업은 간편장부대상자에서 제외되어 수입금액과 관계없이 복식부기의무자입니다(소득세법 시행령 제208조⑤ 단서, 제147조의2). 개원 첫해도 마찬가지입니다.

의원은 단순경비율을 쓸 수 있나요?

쓸 수 없습니다. 시행령 제143조⑦은 의료업 등 제147조의2 사업자를 단순경비율 적용대상자에서 제외합니다. 장부 없이 추계 신고하면 기준경비율의 1/2만 인정되고 무기장 가산세가 붙습니다(제143조③1다).

의원 성실신고확인 기준은 얼마인가요?

보건업은 해당 연도 수입금액 5억원 이상이면 성실신고확인 대상입니다(소득세법 시행령 제133조①3). 성실신고확인대상자는 6월 30일까지 세무사 등이 작성한 성실신고확인서를 붙여 신고합니다.

외부세무조정 대상은 어떻게 정하나요?

보건업은 직전연도 수입금액 1억 5천만원 이상이면 외부세무조정 대상입니다. 또 복식부기의무자가 직전연도에 추계로 결정받았거나, 직전연도에 개업했거나, 조세특례 감면·공제를 받은 경우도 대상이 될 수 있습니다(시행령 제131조의2, 예외 있음).

TaxEasy로 의원 종합소득세를 신고할 수 있나요?

TaxEasy는 복식부기의무자 신고, 외부세무조정, 성실신고확인을 지원하지 않습니다. 의원은 모두 복식부기의무자이므로 사실상 TaxEasy 지원 범위 밖이며, 세무대리인과 진행하시길 권합니다. 봉직의(근로소득)라면 연말정산이 기본입니다.

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참고 자료

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